| Departament Techniki |
| Departament Certyfikacji i Oceny Zgodności |
| Departament Innowacji i Rozwoju |
| Centralne Laboratorium Dozoru Technicznego |
| Departament Administracji i Infrastruktury |
| Departament Informatyki |
| Departament Finansowy |
| Departament Kadr |
| Departament Prawno - Organizacyjny |
| Zespół Ochrony Informacji Niejawnych |
| Zespół Bezpieczeństwa i Higieny Pracy oraz Ochrony Przeciwpożarowej |
| Zespół Kontroli i Audytu Wewnętrznego |
Oddziały terenowe
Oddział terenowy z siedzibą w Gdańsku; Oddział terenowy z siedzibą w Katowicach; Oddział terenowy z siedzibą w Krakowie; Oddział terenowy z siedzibą w Lublinie; Oddział terenowy z siedzibą w Łodzi; Oddział terenowy z siedzibą w Płocku; Oddział terenowy z siedzibą w Poznaniu; Oddział terenowy z siedzibą w Szczecinie; |
Organizację wewnętrzną i szczegółowy zakres zadań komórek organizacyjnych określa regulamin organizacyjny nadany przez Prezesa UDT.
Przy Prezesie UDT działa Kolegium UDT. Kolegium UDT jest organem opiniodawczo-doradczym Prezesa UDT w zakresie przygotowywania projektów rozwiązań służących realizacji oraz zwiększaniu efektywności i jakości działań UDT, określonych w art. 37 ustawy.